12 ทีม ในรอบสาม จะคัดเลือกทีมผ่านเข้ารอบของทั้ง 8 กลุ่ม ทีมแชมป์ของ8กลุ่ม และอันดับ 2 ที่ดีที่สุดจาก 8 กลุ่ม อีก 4 ทีม จะผ่านเข้าสู่รอบสามของเอเชีย กรณีที่ กาตาร์คว้าแชมป์กลุ่ม หรืออยู่ในโผทีมอันดับ 2 ที่ดีที่สุด ทีมอันดับ 2 ที่ดีที่สุด ลำดับที่ 5 จะผ่านเข้าสู่รอบต่อไปแทนเนื่องจากฟีฟ่าไม่อนุญาตให้กาตาร์ ลงเล่นรอบ 12ทีมสุดท้ายเอเชีย เนื่องจากเป็นเจ้าภาพจัดการแข่งขันฟุตบอลโลกรอบสุดท้าย
ขณะเดียวกันมีรายงานล่าสุดว่าทีมชาติเกาหลีเหนืออาจจะถอนทีมจากการแข่งขันรอบที่สองในช่วงเดือน มิ.ย.64 ที่จะถึงนี้ เนื่องจากให้เหตุผลว่าหวั่นสถานการณ์การแพร่ระบาดของโควิด-19 จะไม่ส่งทีมเข้าร่วมการแข่งขันในกลุ่ม เอช ที่ประเทศเกาหลีใต้
หากเกาหลีเหนือถอนตัวตามข่าวจริง การแข่งขันฟุตบอลโลก 2022 รอบคัดเลือกโซนเอเชีย รอบสอง ที่มี 8 กลุ่มๆละ 5 ทีม จะได้รับผลกระทบโดยตรงในเรื่องของการหาทีมเข้ารอบสามโดยเฉพาะในฐานะทีมอันดับสองที่ดีที่สุดของทุกกลุ่ม ทีมอันดับสองของทุกกลุ่มจะถูกตัดผลงานการเจอกับทีมอันดับบ๊วยของตารางออกไป เพื่อให้จำนวนแมตซ์เท่ากับทีมอันดับ 2 ของกลุ่ม เอซ
ในรอบ 12 ทีม จะแบ่งการแข่งขันออกเป็น 2 กลุ่ม ๆละ 6 ทีม ทีมอันดับ 1และ 2 ของแต่ละกลุ่มจะผ่านเข้ารอบสุดท้ายฟุตบอลโลก ส่วนทีมอันดับ 3 ของทั้ง 2 กลุ่ม จะต้องเพลย์ออฟกันเองก่อนที่จะออกไปเพลย์ออฟกับอีก 3 ทวีปประกอบด้วย อเมริกาใต้,คอนคาเคฟ และ โอเซียเนีย ซึ่งจะมีการจับสลากประกบคู่แข่งขันแบบเหย้า-เยือน ต่อไป
GROUP A
โปรแกรมที่เหลือ (แข่งขันที่จีน)
3 มิ.ย.64 ฟิลิปปินส์-กวม, จีน-มัลดิฟส์
7 มิ.ย.64 มัลดิฟส์-ซีเรีย
9 มิ.ย.64 จีน-ฟิลิปปินส์
11 มิ.ย.64 กวม-ซีเรีย
15 มิ.ย.64 ฟิลิปปินส์-มัลดิฟส์, จีน-ซีเรีย
GROUP B
โปรแกรมที่เหลือ(แข่งที่คูเวต)
3 มิ.ย.64 ออสเตรเลีย-คูเวต, เนปาล-ไต้หวัน
7 มิ.ย.64 ออสเตรเลีย-ไต้หวัน, เนปาล-จอร์แดน
11 มิ.ย.64 คูเวต-จอร์แดน, เนปาล-ออสเตรเลีย
15 มิ.ย.64 ออสเตรเลีย-จอร์แดน, ไต้หวัน-คูเวต
GROUP C