จีนได้สร้างโครงสร้างเริ่มต้นบนเสาในพื้นที่ รัฐบาลฟิลิปปินส์ประท้วงการกระทำเหล่านี้

ในปี 1994 และ 1995 จีนได้สร้างโครงสร้างเริ่มต้นบนเสาในพื้นที่ รัฐบาลฟิลิปปินส์ประท้วงการกระทำเหล่านี้ แต่รัฐบาลจีนปฏิเสธการประท้วง โดยอ้างว่าโครงสร้างดังกล่าวเป็นที่พักของชาวประมง ในปี 1999 เมื่อจีนเพิ่ม แนวปะการังมิสชีฟ สิ่งก่อสร้างเพิ่มเติมให้กับแนวปะการังมิสชีฟ การประท้วงอีกระลอกหนึ่งก็มาจากมะนิลา มีรายงานว่าจีนได้ติดตั้งทุ่นบนแนวปะการังซาบีน่าที่อยู่ใกล้เคียงด้วย ฟิลิปปินส์แย้งว่าจีนปฏิบัติตามขั้นตอนที่คิดมาอย่างดีโดยเริ่มจากการวางทุ่นก่อน แล้วจึงสร้างเครื่องหมายคอนกรีตเมื่ออ้างสิทธิ์ในแนวปะการังใหม่ จากนั้นจึงสร้างเพิงพักชั่วคราวที่ทำด้วยไม้หรือไม้ไผ่ ตามมาด้วยโครงสร้างถาวร ดังนั้นฟิลิปปินส์จะพยายามทำลายทุ่นและสัญญาณก่อนที่จีนจะสร้างสิ่งก่อสร้างขนาดใหญ่กว่านี้ ความขัดแย้งที่เพิ่มขึ้นถูกหลีกเลี่ยงโดยการตัดสินใจของฟิลิปปินส์ที่จะไม่ทำลายสิ่งก่อสร้างของจีนบนแนวปะการังมิสชีฟ ฟิลิปปินส์เตรียมพร้อมเสมอหากถูกท้าทายจากความขัดแย้งทางอาวุธ ดังเห็นได้จากจีนยึดแนวปะการังจากเวียดนามในปี 2531 การต่อสู้กันที่แนวปะการังใต้ของจอห์นสัน ซึ่งทำให้ชาวเวียดนามเสียชีวิตกว่า 70 คน อ้างว่าเป็น เมื่อวันที่ 11 กรกฎาคม พ.ศ. 2555 เครื่องบินขับไล่ Type 053 ของจีนได้จอดเรือรบตงกวนบนโขดหิน ทำให้รัฐบาลจีนอับอายและสร้างความลำบากใจทางการทูต จากนั้นเรือก็ถูกลากไปที่ฐาน เมื่อวันที่ 12 กรกฎาคม พ.ศ. 2559 ศาลอนุญาโตตุลาการถาวรสรุปว่าแนวปะการังมิสชีฟถูกเปิดเผยเมื่อน้ำลงและจมอยู่ใต้น้ำเมื่อน้ำขึ้น ดังนั้นจึงจมอยู่ใต้น้ำตามธรรมชาติ การเพิ่มขึ้นของระดับน้ำที่ไม่ได้ให้สิทธิในทะเลอาณาเขต เขตเศรษฐกิจจำเพาะ หรือไหล่ทวีป. ศาลสรุปว่าแนวปะการังมิสชีฟเป็นส่วนหนึ่งของเขตเศรษฐกิจจำเพาะและไหล่ทวีปของฟิลิปปินส์